1956 in Erlangen geboren, assistierte Rainer Schöttl schon während seiner Schulzeit im ITMR, dem damals gnathologisch ausgerichteten Fortbildungsinstitut seines Vaters. Nach dem Abitur folgte eine Lehre als Zahntechniker im väterlichen Labor und das Studium der Zahnheilkunde in den USA. Dort assistierte er bei den von Mahan, Gibbs und Lundeen durchgeführten Forschungsarbeiten über die menschliche Kaubewegung. Während seiner klinischen Ausbildung lernte er Dr. Robert Jankelson und seine Myozentrik kennen und nahm eine Teilzeit Aushilfsstelle in einer myozentrisch engagierten Praxis in Atlanta an. Nach seiner Rückkehr nach Deutschland kam es zu ersten Referaten über die Myozentrik und 1986 zum ersten Kurs gemeinsam mit dem Vater. Schnell wandte sich der Fokus im ITMR der neuromuskulären und myozentrischen Lehre zu und es wurde das erste reguläre myozentrische Kurrikulum in Deutschland aufgebaut. Es folgten Symposien und Fortbildungswochen in den USA.
1989 erhielt Rainer Schöttl vom internationalen Vorstand des ICCMO den Auftrag zur Gründung einer deutschen Sektion, deren Vorsitz er bis heute innehat. 1990 übernahm er die Leitung des ITMR. Als "Master of ICCMO" hielt er auch Fortbildungskurse in den USA, Spanien, Österreich und der Schweiz ab, gab in den 25 Jahren seiner myozentrischen Tätigkeit weit über 100 Vorträge und publizierte  mehrere Duzend Fachveröffentlichungen. Seit 1985 ist er in privater Praxis in Erlangen niedergelassen, deren Schwerpunkt auf der Behandlung Cranio-Mandibulärer Dysfunktionen liegt.